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DNA-encoded chemical libraries (DELs) are powerful drug discovery tools, enabling the parallel screening of millions of DNA-barcoded compounds. We investigated how the DEL input affects the hit discovery rate in DEL screenings. Evaluation of selection fingerprints revealed that the use of approximately 105 copies of each library member is required for the confident identification of nanomolar hits, using generally applicable methodologies.
Puglioli, S., Oehler, S., Prati, L., Scheuermann, J., Bassi, G., Cazzamalli, S., et al. (2023). Impact of library input on the hit discovery rate in DNA-encoded chemical library selections. CHEMICAL SCIENCE, 14(43), 12026-12033 [10.1039/d3sc03688j].
Impact of library input on the hit discovery rate in DNA-encoded chemical library selections
Puglioli S.;Oehler S.;Prati L.;Scheuermann J.;Bassi G.;Cazzamalli S.;Neri D.;Favalli N.
2023
Abstract
DNA-encoded chemical libraries (DELs) are powerful drug discovery tools, enabling the parallel screening of millions of DNA-barcoded compounds. We investigated how the DEL input affects the hit discovery rate in DEL screenings. Evaluation of selection fingerprints revealed that the use of approximately 105 copies of each library member is required for the confident identification of nanomolar hits, using generally applicable methodologies.
Puglioli, S., Oehler, S., Prati, L., Scheuermann, J., Bassi, G., Cazzamalli, S., et al. (2023). Impact of library input on the hit discovery rate in DNA-encoded chemical library selections. CHEMICAL SCIENCE, 14(43), 12026-12033 [10.1039/d3sc03688j].
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/11585/1003808
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
