FICARRA, ELISA
FICARRA, ELISA
RALE051: a novel established cell line of sporadic Burkitt lymphoma
2018 L'Abbate, Alberto; Iacobucci, Ilaria; Lonoce, Angelo; Turchiano, Antonella; Ficarra, Elisa; Paciello, Giulia; Cattina, Federica; Ferrari, Anna; Imbrogno, Enrica; Agostinelli, Claudio; Zinzani, Pier Luigi; Martinelli, Giovanni; Derenzini, Enrico; Storlazzi, Clelia Tiziana
SETD2 Non-Genomic Loss of Function and p53 Functional Inactivation in Advanced Systemic Mastocytosis (SM): Pathogenetic and Therapeutic Implications
2017 Manuela Mancini, Cecilia Monaldi, Sara De Santis, Cristina Papayannidis, Michela Rondoni, Maria Chiara Abbenante, Luana Bavaro, Margherita Martelli, Elisa Ficarra, Giulia Paciello, Viviana Guadagnuolo, Maria Chiara Fontana, Marco Manfrini, Roberta Zanotti, Livio Pagano, Francesco Albano, Fabio Ciceri, Chiara Elena, Patrizia Tosi, Massimo Delledonne, Peter Valent, Michele Cavo, Giovanni Martinelli, Simona Soverini
isomiR-SEA: An RNA-Seq analysis tool for miRNAs/isomiRs expression level profiling and miRNA-mRNA interaction sites evaluation
2016 URGESE, GIANVITO; PACIELLO, GIULIA; ACQUAVIVA, ANDREA; FICARRA, ELISA
Novel fusion transcripts identified by RNAseq cooperate with somatic mutations in the pathogenesis of acute myeloid leukemia
2016 Padella, Antonella; Simonetti, Giorgia; Ferrari, Anna; Paciello, Giulia; Zago, Elisa; Baldazzi, Carmen; Guadagnuolo, Viviana; Papayannidis, Cristina; Robustelli, Valentina; Imbrogno, Enrica; Testoni, Nicoletta; Delledonne, Massimo; Lacobucci, Ilaria; Storlazzi, Tiziana Clelia; Ficarra, Elisa; Lollini, PIER LUIGI; Martinelli, Giovanni
The Genomic and Transcriptomic Landscape of Systemic Mastocytosis
2016 Simona Soverini, Caterina De Benedittis, Michela Rondoni, Cristina Papayannidis, Elisa Ficarra, Giulia Paciello, Marco Manfrini, Manuela Mancini, Roberta Zanotti, Luigi Scaffidi, Giorgina Specchia, Francesco Albano, Serena Merante, Chiara Elena, Livio Pagano, Domenica Gangemi, Patrizia Tosi, Luana Bavaro, Maria Chiara Fontana, Viviana Guadagnuolo, Alberto Ferrarini, Elisa Zago, Michele Cavo, Massimo Delledonne, Peter Valent, Giovanni Martinelli
Convergent Mutations and Kinase Fusions Lead to Oncogenic STAT3 Activation in Anaplastic Large Cell Lymphoma
2015 Ramona Crescenzo; Francesco Abate; Elena Lasorsa; Fabrizio Tabbo’; Marcello Gaudiano; Nicoletta Chiesa; Filomena Di Giacomo; Elisa Spaccarotella; Luigi Barbarossa; Elisabetta Ercole; Maria Todaro; Michela Boi; ACQUAVIVA, ANDREA; FICARRA, ELISA; Domenico Novero; Andrea Rinaldi; Thomas Tousseyn; Andreas Rosenwald; Lukas Kenner; Lorenzo Cerroni; Alexander Tzankov; Maurilio Ponzoni; Marco Paulli; Dennis Weisenburger; Wing C. Chan; Javeed Iqbal; Miguel A. Piris; Alberto Zamo’; Carmela Ciardullo; Davide Rossi; Gianluca Gaidano; Stefano Pileri; Enrico Tiacci; Brunangelo Falini; Leonard D. Shultz; Laurence Mevellec; Jorge E. Vialard; Roberto Piva; Francesco Bertoni; Raul Rabadan; Giorgio Inghirami
RNA Sequencing Reveals Novel and Rare Fusion Transcripts in Acute Myeloid Leukemia
2015 Padella, Antonella; Simonetti, Giorgia; Paciello, Giulia; Ferrari, Anna; Zago, Elisa; Baldazzi, Carmen; Guadagnuolo, Viviana; Papayannidis, Cristina; Robustelli, Valentina; Imbrogno, Enrica; Testoni, Nicoletta; Musuraca, Gerardo; Soverini, Simona; Delledonne, Massimo; Iacobucci, Ilaria; Storlazzi, CLELIA TIZIANA; Ficarra, Elisa; Martinelli, Giovanni
VDJSeq-Solver: In Silico V(D)J Recombination Detection tool
2015 PACIELLO, GIULIA; ACQUAVIVA, ANDREA; Chiara Pighi; Alberto Ferrarini; MACII, Enrico; Alberto Zamò; FICARRA, ELISA
miR-SEA: miRNA Seed Extension based Aligner Pipeline for NGS Expression Level Extraction
2014 URGESE, GIANVITO; PACIELLO, GIULIA; Isella C.; Medico E.; MACII, Enrico; FICARRA, ELISA; ACQUAVIVA, ANDREA
Next-Generation Sequencing Analysis Revealed That BCL11B Chromosomal Translocation Cooperates with Point Mutations in the Pathogenesis of Acute Myeloid Leukemia
2014 Padella, Antonella; Simonetti, Giorgia; Guadagnuolo, Viviana; Ottaviani, Emanuela; Ferrari, Anna; Zago, Elisa; Griggio, Francesca; Garonzi, Marianna; Paciello, Giulia; Bernardi, Simona; Baldazzi, Carmen; Papayannidis, Cristina; Abbenante, Mariachiara; Volpato, Francesca; Calogero, Raffaele; Testoni, Nicoletta; Ficarra, Elisa; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; Iacobucci, Ilaria; Martinelli, Giovanni
Pegasus: a comprehensive annotation and prediction tool for detection of driver gene fusions in cancer
2014 ABATE, FRANCESCO; Sakellarios Zairis; FICARRA, ELISA; ACQUAVIVA, ANDREA; Chris H. Wiggins; Veronique Frattini; Anna Lasorella; Antonio Iavarone; Giorgio Inghirami; Raul Rabadan
Acceleration of Coarse Grain Molecular Dynamics on GPU Architectures
2013 SHKURTI, ARDITA; Mario Orsi; MACII, Enrico; FICARRA, ELISA; ACQUAVIVA, ANDREA
Gelsius: A Literature-Based Workflow for Determining Quantitative Associations between Genes and Biological Processes
2013 ABATE, FRANCESCO; ACQUAVIVA, ANDREA; FICARRA, ELISA; PIVA R.; MACII, Enrico
Improving Latent Semantic Analysis of Biomedical Literature Integrating UMLS Metathesaurus and Biomedical Pathways Databases
2013 ABATE, FRANCESCO; FICARRA, ELISA; ACQUAVIVA, ANDREA; MACII, Enrico
Integration of Literature with Heterogeneous Information for Genes Correlation Scoring
2013 Abate, Francesco; Acquaviva, Andrea; Ficarra, Elisa; Macii, Enrico
A NOVEL ANALYSIS FLOW FOR FUSED TRANSCRIPTS DISCOVERY FROM PAIRED-END RNA-SEQ DATA
2012 ABATE, FRANCESCO; PACIELLO, GIULIA; ACQUAVIVA, ANDREA; FICARRA, ELISA; Ferrarini A.; Delledonne M.; MACII, Enrico
ALK signaling and target therapy in anaplastic large cell lymphoma
2012 F. Tabbó; A. Barreca; R. Piva; G. Inghirami; R. Bruna; D. Corino; D. Cortese; R. Crescenzo; G. Cuccuru; F. Di Giacomo; A. Fioravanti; M. Ladetto; I. Landra; K. Messana; R. Machiorlatti; B. Martinoglio; E. Medico; M. Mossino; E. Pellegrino; M. Todaro; P. Campisi; L. Chiusa; A. Chiappella; D. Novero; U. Vitolo; ABATE, FRANCESCO; ACQUAVIVA, ANDREA; FICARRA, ELISA; R. Freilone; M. Chilosi; A. Zamó; F. Facchetti; S. Lonardi; A. De Chiara; F. Fulciniti; C. Doglioni; M. Ponzoni; L. Agnelli; A. Neri; K. Todoerti; C. Agostinelli; P. P. Piccaluga; S. Pileri; B. Falini; E. Tiacci; P. Van Loo; T. Tousseyn; C. De Wolf Peeters; E. Geissinger; H. K. Muller Hermelink; A. Rosenwald; M. A. Pirisand; M. E. Rodriguez; F. Bertoni; M. Boi; I. Kwee
Multiscale Modelling of Cellular Actin Filaments: From Atomistic Molecular to Coarse Grained Dynamics
2012 Deriu, MARCO AGOSTINO; Shkurti, Ardita; Paciello, Giulia; Bidone, TAMARA CARLA; Morbiducci, Umberto; Ficarra, Elisa; Audenino, Alberto; Acquaviva, Andrea
A Molecular Dynamics study of a miRNA:mRNA interaction
2011 PACIELLO, GIULIA; ACQUAVIVA, ANDREA; FICARRA, ELISA; DERIU, MARCO AGOSTINO; MACII, Enrico
A New Latent Semantic Analysis Based Methodology For Knowledge Extraction From Biomedical Literature And Biological Pathways Databases
2011 ABATE, FRANCESCO; FICARRA, ELISA; ACQUAVIVA, ANDREA; MACII, Enrico
| Titolo | Autore(i) | Anno | Periodico | Editore | Tipo | File |
|---|---|---|---|---|---|---|
| RALE051: a novel established cell line of sporadic Burkitt lymphoma | L'Abbate, Alberto; Iacobucci, Ilaria; Lonoce, Angelo; Turchiano, Antonella; Ficarra, Elisa; Pacie...llo, Giulia; Cattina, Federica; Ferrari, Anna; Imbrogno, Enrica; Agostinelli, Claudio; Zinzani, Pier Luigi; Martinelli, Giovanni; Derenzini, Enrico; Storlazzi, Clelia Tiziana | 2018-01-01 | LEUKEMIA & LYMPHOMA | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
| SETD2 Non-Genomic Loss of Function and p53 Functional Inactivation in Advanced Systemic Mastocytosis (SM): Pathogenetic and Therapeutic Implications | Manuela Mancini, Cecilia Monaldi, Sara De Santis, Cristina Papayannidis, Michela Rondoni, Maria C...hiara Abbenante, Luana Bavaro, Margherita Martelli, Elisa Ficarra, Giulia Paciello, Viviana Guadagnuolo, Maria Chiara Fontana, Marco Manfrini, Roberta Zanotti, Livio Pagano, Francesco Albano, Fabio Ciceri, Chiara Elena, Patrizia Tosi, Massimo Delledonne, Peter Valent, Michele Cavo, Giovanni Martinelli, Simona Soverini | 2017-01-01 | BLOOD | - | 1.06 Abstract in rivista | - |
| isomiR-SEA: An RNA-Seq analysis tool for miRNAs/isomiRs expression level profiling and miRNA-mRNA interaction sites evaluation | URGESE, GIANVITO; PACIELLO, GIULIA; ACQUAVIVA, ANDREA; FICARRA, ELISA | 2016-01-01 | BMC BIOINFORMATICS | - | 1.04 Replica / breve intervento (e simili) | - |
| Novel fusion transcripts identified by RNAseq cooperate with somatic mutations in the pathogenesis of acute myeloid leukemia | Padella, Antonella; Simonetti, Giorgia; Ferrari, Anna; Paciello, Giulia; Zago, Elisa; Baldazzi, C...armen; Guadagnuolo, Viviana; Papayannidis, Cristina; Robustelli, Valentina; Imbrogno, Enrica; Testoni, Nicoletta; Delledonne, Massimo; Lacobucci, Ilaria; Storlazzi, Tiziana Clelia; Ficarra, Elisa; Lollini, PIER LUIGI; Martinelli, Giovanni | 2016-01-01 | CANCER RESEARCH | - | 1.06 Abstract in rivista | - |
| The Genomic and Transcriptomic Landscape of Systemic Mastocytosis | Simona Soverini, Caterina De Benedittis, Michela Rondoni, Cristina Papayannidis, Elisa Ficarra, G...iulia Paciello, Marco Manfrini, Manuela Mancini, Roberta Zanotti, Luigi Scaffidi, Giorgina Specchia, Francesco Albano, Serena Merante, Chiara Elena, Livio Pagano, Domenica Gangemi, Patrizia Tosi, Luana Bavaro, Maria Chiara Fontana, Viviana Guadagnuolo, Alberto Ferrarini, Elisa Zago, Michele Cavo, Massimo Delledonne, Peter Valent, Giovanni Martinelli | 2016-01-01 | BLOOD | - | 1.06 Abstract in rivista | - |
| Convergent Mutations and Kinase Fusions Lead to Oncogenic STAT3 Activation in Anaplastic Large Cell Lymphoma | Ramona Crescenzo; Francesco Abate; Elena Lasorsa; Fabrizio Tabbo’; Marcello Gaudiano; Nicoletta C...hiesa; Filomena Di Giacomo; Elisa Spaccarotella; Luigi Barbarossa; Elisabetta Ercole; Maria Todaro; Michela Boi; ACQUAVIVA, ANDREA; FICARRA, ELISA; Domenico Novero; Andrea Rinaldi; Thomas Tousseyn; Andreas Rosenwald; Lukas Kenner; Lorenzo Cerroni; Alexander Tzankov; Maurilio Ponzoni; Marco Paulli; Dennis Weisenburger; Wing C. Chan; Javeed Iqbal; Miguel A. Piris; Alberto Zamo’; Carmela Ciardullo; Davide Rossi; Gianluca Gaidano; Stefano Pileri; Enrico Tiacci; Brunangelo Falini; Leonard D. Shultz; Laurence Mevellec; Jorge E. Vialard; Roberto Piva; Francesco Bertoni; Raul Rabadan; Giorgio Inghirami | 2015-01-01 | CANCER CELL | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
| RNA Sequencing Reveals Novel and Rare Fusion Transcripts in Acute Myeloid Leukemia | Padella, Antonella; Simonetti, Giorgia; Paciello, Giulia; Ferrari, Anna; Zago, Elisa; Baldazzi, C...armen; Guadagnuolo, Viviana; Papayannidis, Cristina; Robustelli, Valentina; Imbrogno, Enrica; Testoni, Nicoletta; Musuraca, Gerardo; Soverini, Simona; Delledonne, Massimo; Iacobucci, Ilaria; Storlazzi, CLELIA TIZIANA; Ficarra, Elisa; Martinelli, Giovanni | 2015-01-01 | BLOOD | - | 1.06 Abstract in rivista | - |
| VDJSeq-Solver: In Silico V(D)J Recombination Detection tool | PACIELLO, GIULIA; ACQUAVIVA, ANDREA; Chiara Pighi; Alberto Ferrarini; MACII, Enrico; Alberto Zamò...; FICARRA, ELISA | 2015-01-01 | PLOS ONE | - | 1.04 Replica / breve intervento (e simili) | - |
| miR-SEA: miRNA Seed Extension based Aligner Pipeline for NGS Expression Level Extraction | URGESE, GIANVITO; PACIELLO, GIULIA; Isella C.; Medico E.; MACII, Enrico; FICARRA, ELISA; ACQUAVIV...A, ANDREA | 2014-01-01 | - | Copicentro Granada S.L | 4.01 Contributo in Atti di convegno | - |
| Next-Generation Sequencing Analysis Revealed That BCL11B Chromosomal Translocation Cooperates with Point Mutations in the Pathogenesis of Acute Myeloid Leukemia | Padella, Antonella; Simonetti, Giorgia; Guadagnuolo, Viviana; Ottaviani, Emanuela; Ferrari, Anna;... Zago, Elisa; Griggio, Francesca; Garonzi, Marianna; Paciello, Giulia; Bernardi, Simona; Baldazzi, Carmen; Papayannidis, Cristina; Abbenante, Mariachiara; Volpato, Francesca; Calogero, Raffaele; Testoni, Nicoletta; Ficarra, Elisa; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; Iacobucci, Ilaria; Martinelli, Giovanni | 2014-01-01 | BLOOD | - | 1.06 Abstract in rivista | - |
| Pegasus: a comprehensive annotation and prediction tool for detection of driver gene fusions in cancer | ABATE, FRANCESCO; Sakellarios Zairis; FICARRA, ELISA; ACQUAVIVA, ANDREA; Chris H. Wiggins; Veroni...que Frattini; Anna Lasorella; Antonio Iavarone; Giorgio Inghirami; Raul Rabadan | 2014-01-01 | BMC SYSTEMS BIOLOGY | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
| Acceleration of Coarse Grain Molecular Dynamics on GPU Architectures | SHKURTI, ARDITA; Mario Orsi; MACII, Enrico; FICARRA, ELISA; ACQUAVIVA, ANDREA | 2013-01-01 | JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY | - | 1.04 Replica / breve intervento (e simili) | - |
| Gelsius: A Literature-Based Workflow for Determining Quantitative Associations between Genes and Biological Processes | ABATE, FRANCESCO; ACQUAVIVA, ANDREA; FICARRA, ELISA; PIVA R.; MACII, Enrico | 2013-01-01 | IEEE/ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
| Improving Latent Semantic Analysis of Biomedical Literature Integrating UMLS Metathesaurus and Biomedical Pathways Databases | ABATE, FRANCESCO; FICARRA, ELISA; ACQUAVIVA, ANDREA; MACII, Enrico | 2013-01-01 | - | Springer Verlag Germany | 4.01 Contributo in Atti di convegno | - |
| Integration of Literature with Heterogeneous Information for Genes Correlation Scoring | Abate, Francesco; Acquaviva, Andrea; Ficarra, Elisa; Macii, Enrico | 2013-01-01 | ACM JOURNAL ON EMERGING TECHNOLOGIES IN COMPUTING SYSTEMS | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
| A NOVEL ANALYSIS FLOW FOR FUSED TRANSCRIPTS DISCOVERY FROM PAIRED-END RNA-SEQ DATA | ABATE, FRANCESCO; PACIELLO, GIULIA; ACQUAVIVA, ANDREA; FICARRA, ELISA; Ferrarini A.; Delledonne M....; MACII, Enrico | 2012-01-01 | - | - | 4.01 Contributo in Atti di convegno | - |
| ALK signaling and target therapy in anaplastic large cell lymphoma | F. Tabbó; A. Barreca; R. Piva; G. Inghirami; R. Bruna; D. Corino; D. Cortese; R. Crescenzo; G. Cu...ccuru; F. Di Giacomo; A. Fioravanti; M. Ladetto; I. Landra; K. Messana; R. Machiorlatti; B. Martinoglio; E. Medico; M. Mossino; E. Pellegrino; M. Todaro; P. Campisi; L. Chiusa; A. Chiappella; D. Novero; U. Vitolo; ABATE, FRANCESCO; ACQUAVIVA, ANDREA; FICARRA, ELISA; R. Freilone; M. Chilosi; A. Zamó; F. Facchetti; S. Lonardi; A. De Chiara; F. Fulciniti; C. Doglioni; M. Ponzoni; L. Agnelli; A. Neri; K. Todoerti; C. Agostinelli; P. P. Piccaluga; S. Pileri; B. Falini; E. Tiacci; P. Van Loo; T. Tousseyn; C. De Wolf Peeters; E. Geissinger; H. K. Muller Hermelink; A. Rosenwald; M. A. Pirisand; M. E. Rodriguez; F. Bertoni; M. Boi; I. Kwee | 2012-01-01 | FRONTIERS IN ONCOLOGY | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
| Multiscale Modelling of Cellular Actin Filaments: From Atomistic Molecular to Coarse Grained Dynamics | Deriu, MARCO AGOSTINO; Shkurti, Ardita; Paciello, Giulia; Bidone, TAMARA CARLA; Morbiducci, Umber...to; Ficarra, Elisa; Audenino, Alberto; Acquaviva, Andrea | 2012-01-01 | PROTEINS | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
| A Molecular Dynamics study of a miRNA:mRNA interaction | PACIELLO, GIULIA; ACQUAVIVA, ANDREA; FICARRA, ELISA; DERIU, MARCO AGOSTINO; MACII, Enrico | 2011-01-01 | JOURNAL OF MOLECULAR MODELING | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
| A New Latent Semantic Analysis Based Methodology For Knowledge Extraction From Biomedical Literature And Biological Pathways Databases | ABATE, FRANCESCO; FICARRA, ELISA; ACQUAVIVA, ANDREA; MACII, Enrico | 2011-01-01 | - | SciTePress | 4.01 Contributo in Atti di convegno | - |