VASSURA, MARCO
VASSURA, MARCO
CIRI ICT
Blurring contact maps of thousands of proteins: what we can learn by reconstructing 3D structure.
2011 Vassura M.; Di Lena P.; Margara L.; Mirto M.; Aloisio G.; Fariselli P.; Casadio R.
Correlating disease related mutations to their effect on protein stability: a large scale analysis of the human proteome
2011 Casadio R.; Vassura M.; Tiwari S.; Fariselli P.; Martelli P.L.
Divide and Conquer strategies for protein structure prediction.
2011 Di Lena P.; Fariselli P.; Margara L.; Vassura M.; Casadio R.
Is There an Optimal Substitution Matrix for Contact Prediction with Correlated Mutations?
2011 Di Lena P.; Fariselli P.; Margara L.; Vassura M.; Casadio R.
Al-Eigen
2010 P. Di Lena; P. Fariselli; L. Margara; M. Vassura; R. Casadio
Fast overlapping of protein contact maps by aligment of eigenvectors
2010 Di Lena P.; Fariselli P.; Margara L.; Vassura M.; Casadio R.
A graph theoretic approach to protein structure selection.
2009 Vassura M.; Margara L.; Fariselli P.; Casadio R.
A new protein representation based on fragment contacts: towards an improvement of contact maps predictions
2009 Di Lena P; Margara L.; Vassura M.; Fariselli P.; Casadio R.
On the Reconstruction of Three-dimensional Protein Structures from Contact Maps
2009 Pietro Di Lena; Marco Vassura; Luciano Margara; Piero Fariselli; Rita Casadio
On the upper bound of the prediction accuracy of residue contacts in proteins with correlated mutations: the case study of the similarity matrices
2009 P. Di Lena; P. Fariselli; L. Margara; M. Vassura; R. Casadio
The LIBI Grid Platform for Bioinformatics
2009 M. Mirto; I. Epicoco; S. Fiore; M. Cafaro; A. Negro; D. Tartarini; D. Lezzi; O. Marra; A. Turi; A. Ferramosca; V. Zara; G. Aloisio; G. Donvito; L. Carota; G. Cuscela; G. P. Maggi; G. La Rocca; M. Mazzucato; S. My; G. Selvaggi; G. Scioscia; P. Leo; L. Di Pace; G. Pappada'; V. Quinto; M. Berardi; F. Falciano; A. Emerson; E. Rossi; G. Lavorgna; A. Vanni; L. Bartoli; P. Di Lena; P. Fariselli; R. Fronza; L. Margara; L. Montanucci; P. L. Martelli; I. Rossi; M. Vassura; R. Casadio; T. Castrignanò; D. D’Elia; G. Grillo; F. Licciulli; S. Liuni; A. Gisel; M. Santamaria; S. Vicario; C. Saccone; A. Anselmo; D. Horner; F. Mignone; G. Pavesi; E. Picardi; V. Piccolo; M. Re; F. Zambelli; G. Pesole
Unconventional training for neural network predictions of inter-residue contacts
2009 Damiano Piovesan; Pietro Di Lena; Marco Vassura
A new protein representation based on fragment contacts: towards an improvement of contact maps predictions
2008 Di Lena P.; Margara L.; Vassura M.; Fariselli P.; Casadio R.
FT-COMAR
2008 M. Vassura; L. Margara; P. Di Lena; F. Medri; P. Fariselli; R. Casadio
FT-COMAR: fault tolerant three-dimensional structure reconstruction from protein contact maps
2008 Vassura M.; Margara L.; Di Lena P.; Medri F.; Fariselli P.; Casadio R.
Reconstruction of 3D structures from protein contact maps.
2008 Vassura M.; Margara L.; Di Lena P.; Medri F.; Fariselli P.; Casadio R.
The Graph Theory and the Protein Universe: selecting the close-to-the-native structures within a model decoy set
2008 R. Casadio; L. Margara; P. Fariselli; M. Vassura
The LIBI Grid Platform an International Laboratory for Bioinformatics
2008 M. Mirto; I. Epicoco; S. Fiore; M. Cafaro; A. Ferramosca; V. Zara; G. Aloisio G. Scioscia; P. Leo; G. Donvito; G. Cuscela; G. Maggi; A. Pierro; F. Falciano; E. Rossi; T. Castrignanò; P. Fariselli; R. Fronza; L. Margara; L. Montanucci; P. L. Martelli; I. Rossi; M. Vassura; P. Di Lena; R. Casadio; A. Anselmo; G. Grillo; D. Horner; F. Licciulli; S. Liuni; A. Gisel; F. Mignone; G. Pavesi; G. Pesole; E. Picardi; V. Piccolo; M. Re; C. Saccone; M. Santamaria; S. Vicario; F. Zambelli
A Graph Theoretic Approach to Protein Structure Selection
2007 Vassura, Marco; Margara, Luciano; Fariselli, Piero; Casadio, Rita
Fault tolerance for large scale protein 3D reconstruction from contact maps
2007 Vassura M.; Margara L.; Di Lena P.; Medri F.; Fariselli P.; Casadio R.
Titolo | Autore(i) | Anno | Periodico | Editore | Tipo | File |
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Blurring contact maps of thousands of proteins: what we can learn by reconstructing 3D structure. | Vassura M.; Di Lena P.; Margara L.; Mirto M.; Aloisio G.; Fariselli P.; Casadio R. | 2011-01-01 | BIODATA MINING | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
Correlating disease related mutations to their effect on protein stability: a large scale analysis of the human proteome | Casadio R.; Vassura M.; Tiwari S.; Fariselli P.; Martelli P.L. | 2011-01-01 | HUMAN MUTATION | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
Divide and Conquer strategies for protein structure prediction. | Di Lena P.; Fariselli P.; Margara L.; Vassura M.; Casadio R. | 2011-01-01 | - | Springer | 2.01 Capitolo / saggio in libro | - |
Is There an Optimal Substitution Matrix for Contact Prediction with Correlated Mutations? | Di Lena P.; Fariselli P.; Margara L.; Vassura M.; Casadio R. | 2011-01-01 | IEEE/ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
Al-Eigen | P. Di Lena; P. Fariselli; L. Margara; M. Vassura; R. Casadio | 2010-01-01 | - | - | 7.04 Software | - |
Fast overlapping of protein contact maps by aligment of eigenvectors | Di Lena P.; Fariselli P.; Margara L.; Vassura M.; Casadio R. | 2010-01-01 | BIOINFORMATICS | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
A graph theoretic approach to protein structure selection. | Vassura M.; Margara L.; Fariselli P.; Casadio R. | 2009-01-01 | ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN MEDICINE | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
A new protein representation based on fragment contacts: towards an improvement of contact maps predictions | Di Lena P; Margara L.; Vassura M.; Fariselli P.; Casadio R. | 2009-01-01 | - | Springer | 4.01 Contributo in Atti di convegno | - |
On the Reconstruction of Three-dimensional Protein Structures from Contact Maps | Pietro Di Lena; Marco Vassura; Luciano Margara; Piero Fariselli; Rita Casadio | 2009-01-01 | ALGORITHMS | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
On the upper bound of the prediction accuracy of residue contacts in proteins with correlated mutations: the case study of the similarity matrices | P. Di Lena; P. Fariselli; L. Margara; M. Vassura; R. Casadio | 2009-01-01 | - | Springer | 4.01 Contributo in Atti di convegno | - |
The LIBI Grid Platform for Bioinformatics | M. Mirto; I. Epicoco; S. Fiore; M. Cafaro; A. Negro; D. Tartarini; D. Lezzi; O. Marra; A. Turi; A.... Ferramosca; V. Zara; G. Aloisio; G. Donvito; L. Carota; G. Cuscela; G. P. Maggi; G. La Rocca; M. Mazzucato; S. My; G. Selvaggi; G. Scioscia; P. Leo; L. Di Pace; G. Pappada'; V. Quinto; M. Berardi; F. Falciano; A. Emerson; E. Rossi; G. Lavorgna; A. Vanni; L. Bartoli; P. Di Lena; P. Fariselli; R. Fronza; L. Margara; L. Montanucci; P. L. Martelli; I. Rossi; M. Vassura; R. Casadio; T. Castrignanò; D. D’Elia; G. Grillo; F. Licciulli; S. Liuni; A. Gisel; M. Santamaria; S. Vicario; C. Saccone; A. Anselmo; D. Horner; F. Mignone; G. Pavesi; E. Picardi; V. Piccolo; M. Re; F. Zambelli; G. Pesole | 2009-01-01 | - | IGI global | 2.01 Capitolo / saggio in libro | - |
Unconventional training for neural network predictions of inter-residue contacts | Damiano Piovesan; Pietro Di Lena; Marco Vassura | 2009-01-01 | - | ACM | 4.01 Contributo in Atti di convegno | - |
A new protein representation based on fragment contacts: towards an improvement of contact maps predictions | Di Lena P.; Margara L.; Vassura M.; Fariselli P.; Casadio R. | 2008-01-01 | - | s.n | 4.02 Riassunto (Abstract) | - |
FT-COMAR | M. Vassura; L. Margara; P. Di Lena; F. Medri; P. Fariselli; R. Casadio | 2008-01-01 | - | - | 7.04 Software | - |
FT-COMAR: fault tolerant three-dimensional structure reconstruction from protein contact maps | Vassura M.; Margara L.; Di Lena P.; Medri F.; Fariselli P.; Casadio R. | 2008-01-01 | BIOINFORMATICS | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
Reconstruction of 3D structures from protein contact maps. | Vassura M.; Margara L.; Di Lena P.; Medri F.; Fariselli P.; Casadio R. | 2008-01-01 | IEEE/ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS | - | 1.01 Articolo in rivista | - |
The Graph Theory and the Protein Universe: selecting the close-to-the-native structures within a model decoy set | R. Casadio; L. Margara; P. Fariselli; M. Vassura | 2008-01-01 | - | Bononia University Press | 2.01 Capitolo / saggio in libro | - |
The LIBI Grid Platform an International Laboratory for Bioinformatics | M. Mirto; I. Epicoco; S. Fiore; M. Cafaro; A. Ferramosca; V. Zara; G. Aloisio G. Scioscia; P. Leo...; G. Donvito; G. Cuscela; G. Maggi; A. Pierro; F. Falciano; E. Rossi; T. Castrignanò; P. Fariselli; R. Fronza; L. Margara; L. Montanucci; P. L. Martelli; I. Rossi; M. Vassura; P. Di Lena; R. Casadio; A. Anselmo; G. Grillo; D. Horner; F. Licciulli; S. Liuni; A. Gisel; F. Mignone; G. Pavesi; G. Pesole; E. Picardi; V. Piccolo; M. Re; C. Saccone; M. Santamaria; S. Vicario; F. Zambelli | 2008-01-01 | - | s.n | 4.02 Riassunto (Abstract) | - |
A Graph Theoretic Approach to Protein Structure Selection | Vassura, Marco; Margara, Luciano; Fariselli, Piero; Casadio, Rita | 2007-01-01 | - | Springer Berlin Heidelberg | 2.01 Capitolo / saggio in libro | - |
Fault tolerance for large scale protein 3D reconstruction from contact maps | Vassura M.; Margara L.; Di Lena P.; Medri F.; Fariselli P.; Casadio R. | 2007-01-01 | - | Springer Berlin Heidelberg | 2.01 Capitolo / saggio in libro | - |