In questo capitolo sono proposti alcuni esempi che illustrano le principali proprietà dei modelli multiscala. Come primo esempio, è presentata un’introduzione ai modelli della regolazione trascrizionale, per mostrare come interazioni molecolari tra un sito operatore di un promotore genico e specifiche proteine regolatrici possano determinare complesse funzioni cellulari. Per esemplificare il passaggio dalla scala atomica a quella macromolecolare sono illustrati alcuni risultati sul rapporto tra struttura e funzione di una proteina canale. Infine, per illustrare il ruolo della modellistica nelle analisi farmaco-genetiche è presentato un esempio di studio “in silico” dell’effetto delle disfunzioni di una proteina su una funzione cellulare. Gli esempi proposti trascurano i dettagli metodologici – per i quali si rimanda a letture specifiche – vista la complessità dei singoli argomenti e sono usati, invece, per rendere evidente come mediante i modelli si possano coniugare i processi che avvengono su una scala con le funzioni che essi realizzano su una scala superiore.

Modelli multiscala per studi di proteomica e genomica funzionale / S. Cavalcanti; S. Furini; E. Giordano. - STAMPA. - (2007), pp. 295-322.

Modelli multiscala per studi di proteomica e genomica funzionale

CAVALCANTI, SILVIO;FURINI, SIMONE;GIORDANO, EMANUELE DOMENICO
2007

Abstract

In questo capitolo sono proposti alcuni esempi che illustrano le principali proprietà dei modelli multiscala. Come primo esempio, è presentata un’introduzione ai modelli della regolazione trascrizionale, per mostrare come interazioni molecolari tra un sito operatore di un promotore genico e specifiche proteine regolatrici possano determinare complesse funzioni cellulari. Per esemplificare il passaggio dalla scala atomica a quella macromolecolare sono illustrati alcuni risultati sul rapporto tra struttura e funzione di una proteina canale. Infine, per illustrare il ruolo della modellistica nelle analisi farmaco-genetiche è presentato un esempio di studio “in silico” dell’effetto delle disfunzioni di una proteina su una funzione cellulare. Gli esempi proposti trascurano i dettagli metodologici – per i quali si rimanda a letture specifiche – vista la complessità dei singoli argomenti e sono usati, invece, per rendere evidente come mediante i modelli si possano coniugare i processi che avvengono su una scala con le funzioni che essi realizzano su una scala superiore.
2007
GENOMICA E PROTEOMICA FUNZIONALE
295
322
Modelli multiscala per studi di proteomica e genomica funzionale / S. Cavalcanti; S. Furini; E. Giordano. - STAMPA. - (2007), pp. 295-322.
S. Cavalcanti; S. Furini; E. Giordano
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