Helicobacter pyori è un patogeno gastrico molto diffuso che può infettare l'uomo per tutto l'arco della sua vita. Le infezioni possono essere curate con antibiotici, tuttavia in mancanza di trattamento medico il batterio può proliferare asintomaticamente per anni, promuovendo l'insorgere di sintomatologie gravi come l'ulcera peptica e tumori gastrici, tanto che il batterio è stato classificato dall'OMS come oncogeno di classe 1. Durante l'infezione, H. pylori attraversa la mucosa gastrica per porsi a stretto contatto con l'epitelio gastrico. La gravità dei sintomi indotti dipende in larga misura dal genotipo del ceppo infettivo ed in particolare dal genotipo di alcuni geni di virulenza, come quelli dell'isola di patogenicità cag (cag-PAI) che codifica per un sistema di secrezione di tipo 4 (T4SS), responsabile dell'iniezione della tossina CagA nelle cellule dell'ospite. Molto importanti in questo processo sono alcuni enzimi e regolatori metallo-dipendenti, che partecipano insieme ad altri effettori batterici a funzioni essenziali come respirazione, detossificazione, risposta a stress e virulenza. Queste funzioni sono controllate a livello trascrizionale da una complesso network di regolazione, dotato di 17 soli fattori/regolatori trascrizionali. I regolatori pleiotropici Fur e NikR, il regolatore di risposta essenziale HP1043, ed il circuito di risposta da stress che coinvolge HspR ed HrcA, sembrano essere molto importanti in questo network di regolazione, come ben evidenziato da letalità batterica o da difetti di colonizzazione in modelli sperimentali di infezione, come anche da antibiotico-resistenza indotta da una loro mutazione. Proponiamo uno studio integrato del contributo dei singoli regolatori al circuito globale, che preveda l'uso di ChIP-seq e di analisi di footprinting del DNA, la mappatura dei promotori come anche l'analisi trascrizionale approfondita di geni coinovlti in: i) colonizzazione e persistenza (per es.; l'idrogenasi e le sue chaperonine); ii) antibiotico resistenza (ossidoreduttasi e accettori di elettroni); virulenza (geni cag, e fattori di sequestramento del ferro solubile).
PRIN 2011: Unraveling structural and functional determinants behind Helicobacter pylori pathogenesis and persistence
SCARLATO, VINCENZO
In corso di stampa
Abstract
Helicobacter pyori è un patogeno gastrico molto diffuso che può infettare l'uomo per tutto l'arco della sua vita. Le infezioni possono essere curate con antibiotici, tuttavia in mancanza di trattamento medico il batterio può proliferare asintomaticamente per anni, promuovendo l'insorgere di sintomatologie gravi come l'ulcera peptica e tumori gastrici, tanto che il batterio è stato classificato dall'OMS come oncogeno di classe 1. Durante l'infezione, H. pylori attraversa la mucosa gastrica per porsi a stretto contatto con l'epitelio gastrico. La gravità dei sintomi indotti dipende in larga misura dal genotipo del ceppo infettivo ed in particolare dal genotipo di alcuni geni di virulenza, come quelli dell'isola di patogenicità cag (cag-PAI) che codifica per un sistema di secrezione di tipo 4 (T4SS), responsabile dell'iniezione della tossina CagA nelle cellule dell'ospite. Molto importanti in questo processo sono alcuni enzimi e regolatori metallo-dipendenti, che partecipano insieme ad altri effettori batterici a funzioni essenziali come respirazione, detossificazione, risposta a stress e virulenza. Queste funzioni sono controllate a livello trascrizionale da una complesso network di regolazione, dotato di 17 soli fattori/regolatori trascrizionali. I regolatori pleiotropici Fur e NikR, il regolatore di risposta essenziale HP1043, ed il circuito di risposta da stress che coinvolge HspR ed HrcA, sembrano essere molto importanti in questo network di regolazione, come ben evidenziato da letalità batterica o da difetti di colonizzazione in modelli sperimentali di infezione, come anche da antibiotico-resistenza indotta da una loro mutazione. Proponiamo uno studio integrato del contributo dei singoli regolatori al circuito globale, che preveda l'uso di ChIP-seq e di analisi di footprinting del DNA, la mappatura dei promotori come anche l'analisi trascrizionale approfondita di geni coinovlti in: i) colonizzazione e persistenza (per es.; l'idrogenasi e le sue chaperonine); ii) antibiotico resistenza (ossidoreduttasi e accettori di elettroni); virulenza (geni cag, e fattori di sequestramento del ferro solubile).I documenti in IRIS sono protetti da copyright e tutti i diritti sono riservati, salvo diversa indicazione.
