Nel periodo 1995-2006, nel corso di programmi di sorveglianza virologica in Italia centrale e del Nord, sono stati isolati ceppi di influenza aviaria di sottotipo H1N1 da uccelli acquatici selvatici e domestici. 13 di questi ceppi sono stati caratterizzati geneticamente, e confrontati con ceppi dello stesso sottotipo isolati da suini di allevamenti italiani. a) definire le caratteristiche molecolari ed evolutive della popolazione di virus H1N1 aviari del lineaggio Eurasiatico; b) valutare le relazioni filogenetiche di questi ceppi con quelli di ceppi suini che circolano regolarmente negli allevamenti suini, e con virus umani; c) valutare le dinamiche di persistenza/variazione di virus aviari H1N1 nel serbatoio naturale in stagioni successive. Tamponi cloacali sono stati raccolti da uccelli selvatici e domestici, inoculati in uova embrionate di pollo e i liquidi allantoidei positivi per influenza sono stati tipizzati sierologicamente. L'RNA di 13 isolati aviari H1N1 e di 7 ceppi suini è stato estratto, sottoposto a trascrizione inversa, PCR e sequenziamento. Le sequenze degli 8 segmenti di ciascun virus sono state utilizzate per l'analisi filogenetica. L'analisi filogenetica del gene HA mostra che tutti i ceppi aviari italiani sono più simili ad alcuni ceppi del Giappone, formando due subclades minori, nettamente distinti dal lineaggio dei virus suini italiani. Quest'ultima evidenza si conferma anche nel resto del genoma. Inoltre, in ognuno dei geni interni, i virus si dividono in 3 o più clusters distinti e diversi tra loro. Conclusioni. Questo lavoro rappresenta la prima caratterizzazione estensiva di virus H1N1 aviari eurasiatici, importante anche perché permette di definire meglio i rapporti di derivazione del virus H1N1 umano di origine aviaria responsabile della pandemia del 1918. I dati dimostrano che l'HA dell'H1 aviaria forma un gruppo filogeneticamente molto ben 26 distinto sia dai ceppi aviari americani che dai ceppi suini e umani. Relativamente ai restanti geni, per effetto dello scambio di virus legato alle migrazioni degli uccelli selvatici, le costellazioni geniche di questi virus differiscono tra di loro sia da un anno all'altro, sia nello stesso anno. Infine, nessuna trasmissione interspecie sembra essersi verificata tra ceppi aviari e suini italiani.
Studio molecolare ed evolutivo di virus influenzali H1N1 di lineaggio euroasiatico, isolati in Italia (1995-2006) da uccelli acquatici selvatici e domestici, e confronto con virus dello stesso sottotipo circolanti in suini in Italia
De Marco MA;DELOGU, MAURO;
2009
Abstract
Nel periodo 1995-2006, nel corso di programmi di sorveglianza virologica in Italia centrale e del Nord, sono stati isolati ceppi di influenza aviaria di sottotipo H1N1 da uccelli acquatici selvatici e domestici. 13 di questi ceppi sono stati caratterizzati geneticamente, e confrontati con ceppi dello stesso sottotipo isolati da suini di allevamenti italiani. a) definire le caratteristiche molecolari ed evolutive della popolazione di virus H1N1 aviari del lineaggio Eurasiatico; b) valutare le relazioni filogenetiche di questi ceppi con quelli di ceppi suini che circolano regolarmente negli allevamenti suini, e con virus umani; c) valutare le dinamiche di persistenza/variazione di virus aviari H1N1 nel serbatoio naturale in stagioni successive. Tamponi cloacali sono stati raccolti da uccelli selvatici e domestici, inoculati in uova embrionate di pollo e i liquidi allantoidei positivi per influenza sono stati tipizzati sierologicamente. L'RNA di 13 isolati aviari H1N1 e di 7 ceppi suini è stato estratto, sottoposto a trascrizione inversa, PCR e sequenziamento. Le sequenze degli 8 segmenti di ciascun virus sono state utilizzate per l'analisi filogenetica. L'analisi filogenetica del gene HA mostra che tutti i ceppi aviari italiani sono più simili ad alcuni ceppi del Giappone, formando due subclades minori, nettamente distinti dal lineaggio dei virus suini italiani. Quest'ultima evidenza si conferma anche nel resto del genoma. Inoltre, in ognuno dei geni interni, i virus si dividono in 3 o più clusters distinti e diversi tra loro. Conclusioni. Questo lavoro rappresenta la prima caratterizzazione estensiva di virus H1N1 aviari eurasiatici, importante anche perché permette di definire meglio i rapporti di derivazione del virus H1N1 umano di origine aviaria responsabile della pandemia del 1918. I dati dimostrano che l'HA dell'H1 aviaria forma un gruppo filogeneticamente molto ben 26 distinto sia dai ceppi aviari americani che dai ceppi suini e umani. Relativamente ai restanti geni, per effetto dello scambio di virus legato alle migrazioni degli uccelli selvatici, le costellazioni geniche di questi virus differiscono tra di loro sia da un anno all'altro, sia nello stesso anno. Infine, nessuna trasmissione interspecie sembra essersi verificata tra ceppi aviari e suini italiani.I documenti in IRIS sono protetti da copyright e tutti i diritti sono riservati, salvo diversa indicazione.
